支气管洗涤液上清液作为新型液体活检标本,用于晚期非小细胞肺癌的基因组分析的价值
肿瘤组织是晚期肺癌分子检测的主要底物。然而,对于一些患者来说,从活检中获得足够的组织样本进行分子检测通常具有挑战性。支气管清洗液上清液(BWFS)含有肿瘤来源的DNA,可作为基因分型的补充剂。本研究的目的是评估检测BWFS样本中基因改变的有效性和精度,并评估其临床潜力。
研究方法
2022年6月至2024年5月期间前瞻性纳入了38例III-IV期非小细胞肺癌(NSCLC)患者。同时收集每位患者的BWFS、匹配肿瘤组织(TIS)和血浆(PLA),所有样本均对520个癌症相关基因或168个癌症相关基因进行下一代测序(NGS)。
研究结果
在38名患者的队列中,28名患者同时获得了来自3个不同样本的NGS结果。与PLA相比,BWFS含有更丰富的肿瘤来源DNA,并表现出更高的最大等位基因频率(max_AF)和更高的突变检出率(BWFS:96.4%,PLA:85.7%),与TIS(BWFS:96.4%,TIS:100%)一致。
从三种样本类型(TIS:225,BWFS:209,PLA:102)中共检测到536个突变事件。使用TIS作为金标准,与PLA相比,BWFS表现出更高的灵敏度(78.22%对36%)。
对于不同的变异,与BWFS相比,PLA中拷贝数变异(CNV)和融合更难检测。基于TIS和BWFS的肿瘤突变负荷(TMB)估计值高度相关(Pearsonr=0.97)。
结语
该研究首次证明BWFS在通过NGS对晚期NSCLC进行基因分型方面的性能与匹配的TIS相当,优于PLA。BWFS是一种有价值的标本,尤其是在肿瘤组织不足的患者中。
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